Добрый день.
Цитата: Не должно.
Не должно, но как правило такие отношения всегда обнаруживаются. Посторонний человек никогда не пойдёт забирать у продавца чужой автомобиль. Это либо трудовые отношения, не оформленные в письменном виде. Либо это поручение, которое в случае безвозмездности обязательно должно быть оформлено в форме договора:
Цитата: 1. Доверитель обязан уплатить поверенному вознаграждение, если это предусмотрено законом, иными правовыми актами или договором поручения.В случаях, когда договор поручениясвязан с осуществлениемобеими сторонами илиодной из них предпринимательской деятельности, доверительобязан уплатитьповеренномувознаграждение,еслидоговоромне предусмотрено иное.
Цитата: данный автомобиль забирал один из наших сотрудников, но документально он в компании покупателя не трудоустроен.
А фактически в каких отношениях находится этот
ваш сотрудник с организацией? В неоформленных трудовых?
Цитата: Как данная ошибка повлияет на вычет по НДС по этому УПД?
Например, если налоговая решит, что это притворная сделка - автомобиль оформлен на вашу организацию, а фактически им пользуется другая, чей сотрудник его и получил.
Опишите ситуацию подробнее, чтобы не фантазировать, а оценить реальные риски.